Usando o conjunto de regras da 3ª Edição de Dungeons & Dragons, Baldur's Gate: Dark Alliance II apresenta quatro novos atos de combate hack-and-slash e poderosa conjuração de feitiços. Ainda mais tipos de monstros se envolverão em batalhas em tempo real usando a mesma perspectiva de sobrecarga testemunhada no jogo original. Cada personagem selecionado pode aproveitar a experiência adquirida com o combate para adquirir novos talentos e habilidades aprimoradas ao longo do tempo. Para ajudar na batalha, um novo sistema de criação de itens permite que os jogadores criem armas e armaduras mágicas usando matérias-primas encontradas durante suas viagens. Como antes, dois heróis podem se juntar à aventura em um jogo cooperativo na mesma tela, com cada personagem diferindo nos tipos de talentos e poderes sob seu comando. Equipamentos podem ser encontrados ou comprados de comerciantes locais usando o ouro saqueado de criaturas abatidas ou recebido como pagamento por missões. Baldur's Gate: Dark Alliance II também apresenta uma série de áreas escondidas, personagens secretos e literalmente centenas de itens para encontrar e usar, incluindo poções, pergaminhos e varinhas. Além disso, o jogo apresenta um novo enredo de ramificação que oferece aos jogadores uma escolha para onde ir em seguida em busca de fortuna e honra.

Esta sequência do jogo de RPG de ação de sucesso de 2002, ambientado no universo de Dungeons & Dragons, começa exatamente onde o original parou. O misterioso desaparecimento da Torre Onyx e a morte de Eldrith, o Traidor, deixaram os nobres heróis presos em um cenário desconhecido. No entanto, a cidade portuária de Baldur's Gate ainda faz parte de um plano hediondo para controlar os Reinos Esquecidos. Cinco novos tipos de personagens prometem parar quem ou o que quer que esteja por trás dessa nova aliança, custe o que custar.