O Senhor dos Anéis:A Terceira Era introduz personagens inteiramente novos que não são mencionados nos livros ou filmes. O jogo se relaciona com os filmes, incluindo cenas de todos os três filmes, com novo discurso de fundo de Ian McKellen (Gandalf). Existem sete personagens jogáveis no jogo que foram criados especificamente para ele, bem como pequenas aparições de personagens como Gandalf, Aragorn, Eowyn, Faramir e Gothmog. O jogo cobre eventos em todos os três filmes/livros, principalmente com referências a grandes eventos mostrados através de cenas cortadas, ou as cenas dos filmes com a narração de Ian McKellan. Um jogo de RPG clássico, O Senhor dos Anéis: A Terceira Era tem elementos de jogabilidade semelhantes a Final Fantasy, onde você tem um grupo de personagens, cada um com um conjunto diferente de habilidades e atributos, que ganham níveis, tornando-os mais fortes à medida que o jogo avança. As batalhas são baseadas em turnos e permitem que o jogador tome decisões diferentes sobre o que deseja fazer para mudar o resultado da batalha. O jogo viaja por muitas áreas da Terra Média de Tolkien, incluindo The Pelennor Fields e Moria.

Ao lutar para destruir o anel, você interagirá com os diferentes personagens de sua equipe, assumirá atribuições individuais e viajará por terras familiares e pouco vistas - utilizando o sistema de luta exclusivo baseado em turnos o tempo todo.