Com base no programa PBS Kids, The Magic School Bus, juntamente com a Sra. Frizzle e sua companheira Liz, leva o jogador por todo o sistema solar, um planeta de cada vez, para aprender sobre eles enquanto explora cada um. Ao longo do caminho, os jogadores serão transportados no ônibus a caminho do próximo planeta, onde poderão tirar fotos dos planetas, suas luas, estrelas, entre muitas outras coisas que podem ver. Ao longo do caminho, eles encontrarão quebra-cabeças que precisam resolver para avançar usando os fatos que aprenderam em sua visita planetária e também podem construir seu próprio sistema solar da maneira que escolherem.