Mega Man Zero 4 is a video game created by Capcom and Inti Creates for the Game Boy Advance in 2005. It's the fourth and final installment in the Mega Man Zero series, making Zero the first Mega Man subseries to see a proper conclusion. The game introduces the Zero Knuckle, a weapon that lets Zero steal other enemies' weapons and use them for himself, as well as a new mechanic where Zero can alter weather conditions before entering one of the eight main levels.

Mesmo com a morte de Omega no último jogo, a Dra. Weil ainda é a líder indiscutível da Neo Arcadia. Com seu governo de punho de ferro, humanos e Reploids estão agora sob opressão. O jogo começa com uma Caravana humana escapando do que já foi sua casa, sendo perseguida por um novo tipo de soldados inimigos, a Variante. Zero e a Resistência se juntam à perseguição, lutando contra as Variantes e salvando os humanos. Ciel e Zero encontram o líder da Caravana, Neige, que lhes conta sobre a situação atual em Neo Arcadia, e que agora ela está liderando seu grupo para a Área Zero, onde um assentamento humano foi estabelecido. O comboio da Resistência segue a Caravana para a Área Zero. Explorando o habitat, Zero logo encontra os Oito Guerreiros Einherjar e seu líder, Craft. Através deles, Zero aprende sobre a Operação Ragnarok, uma operação militar em que Weil planeja destruir todos os lugares habitáveis, como a Área Zero, para que os humanos parem de fugir de Neo Arcadia. Os Einherjar e a Arte são os únicos que executarão este plano, pensando que os humanos são tolos em pensar em fugir do governo de Weil.